MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bordetella pertussis Tohama I chromosome

Total Repeats: 19214

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_002929	CTG	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_002929	CGG	2	6	5166	5171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_002929	GC	3	6	5183	5188	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_002929	GCG	2	6	5204	5209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_002929	GGC	2	6	5247	5252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_002929	GGCC	2	8	5265	5272	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_002929	GC	3	6	5275	5280	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_002929	GGC	2	6	5336	5341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_002929	GC	3	6	5352	5357	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10	NC_002929	CGC	3	9	5355	5363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_002929	CGA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_002929	CGAC	2	8	5381	5388	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_002929	GGT	2	6	5469	5474	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_002929	GCT	2	6	5475	5480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_002929	TGA	2	6	5591	5596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_002929	GCC	2	6	5635	5640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_002929	CGC	2	6	5649	5654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_002929	TTCGC	2	10	5656	5665	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_002929	GGCCG	2	10	5674	5683	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_002929	CGGC	2	8	5697	5704	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_002929	GCC	2	6	5734	5739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_002929	GCT	2	6	5745	5750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_002929	GCA	2	6	5769	5774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_002929	GC	3	6	5927	5932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_002929	GGT	2	6	5943	5948	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_002929	CGA	3	9	5997	6005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_002929	GCC	2	6	6022	6027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_002929	TGC	2	6	6056	6061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_002929	CG	3	6	6093	6098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
30	NC_002929	GTT	2	6	6108	6113	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_002929	GCG	2	6	6133	6138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_002929	CGG	2	6	6154	6159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_002929	GCC	2	6	6164	6169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_002929	GGA	2	6	6236	6241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_002929	CCT	2	6	6311	6316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_002929	CCA	2	6	6317	6322	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_002929	AGC	2	6	6372	6377	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_002929	GC	3	6	6376	6381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_002929	GGA	2	6	6482	6487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_002929	ACG	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_002929	TTC	3	9	6678	6686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_002929	AGT	2	6	7972	7977	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_002929	TATG	2	8	7980	7987	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_002929	CCG	2	6	8100	8105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_002929	CGG	2	6	8131	8136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_002929	TGC	2	6	10319	10324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_002929	GTT	2	6	10352	10357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_002929	GAA	2	6	10434	10439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_002929	CAG	2	6	11589	11594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_002929	ACTG	2	8	20025	20032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_002929	GC	3	6	20037	20042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_002929	A	7	7	20069	20075	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_002929	ATA	2	6	20617	20622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_002929	GGC	2	6	20630	20635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_002929	GAC	2	6	20671	20676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_002929	T	6	6	20749	20754	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_002929	CACG	2	8	21974	21981	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_002929	GCA	2	6	22037	22042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_002929	CGG	2	6	22055	22060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_002929	TGA	2	6	22082	22087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_002929	CGGCC	2	10	22091	22100	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
62	NC_002929	GCC	2	6	22149	22154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_002929	TTCG	2	8	22158	22165	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_002929	CGG	2	6	22169	22174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_002929	CG	3	6	22181	22186	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_002929	CGT	2	6	22235	22240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_002929	CACG	2	8	22271	22278	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_002929	CGGA	2	8	22301	22308	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_002929	CAG	2	6	22329	22334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_002929	CTG	2	6	22347	22352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_002929	GTC	2	6	22362	22367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_002929	TCG	2	6	22396	22401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_002929	CG	5	10	22418	22427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_002929	TCG	2	6	22442	22447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_002929	GCA	2	6	22458	22463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_002929	CG	3	6	22507	22512	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_002929	TCG	2	6	22529	22534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_002929	CTG	2	6	22588	22593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_002929	CCA	2	6	22623	22628	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_002929	GCG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_002929	CG	3	6	22651	22656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_002929	TCG	2	6	22760	22765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_002929	GC	3	6	22776	22781	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_002929	GCG	2	6	22857	22862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_002929	TCG	2	6	22901	22906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_002929	GC	3	6	22913	22918	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_002929	CGG	2	6	22929	22934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_002929	GGCGC	2	10	22947	22956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
89	NC_002929	CGC	2	6	22987	22992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_002929	GCCG	2	8	23010	23017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_002929	CG	3	6	23016	23021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_002929	GCGTC	2	10	23034	23043	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_002929	CG	3	6	23091	23096	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_002929	CAG	2	6	23146	23151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_002929	CGG	2	6	23179	23184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_002929	GCA	2	6	23226	23231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_002929	CCAGCA	2	12	23274	23285	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_002929	CGG	2	6	23296	23301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_002929	GCC	2	6	23381	23386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_002929	CAG	3	9	23416	23424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_002929	GCAGC	2	10	23430	23439	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_002929	GC	3	6	23488	23493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_002929	GCA	2	6	23499	23504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_002929	GAT	2	6	23512	23517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_002929	CGCC	2	8	23523	23530	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_002929	CCA	2	6	23595	23600	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_002929	GCA	2	6	23643	23648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_002929	G	7	7	23680	23686	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
109	NC_002929	GGCC	2	8	23709	23716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_002929	CGC	2	6	23757	23762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_002929	TCA	2	6	23769	23774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_002929	GCA	2	6	23835	23840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_002929	TGA	2	6	23865	23870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_002929	GCG	3	9	23879	23887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_002929	GCG	2	6	23907	23912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_002929	CG	4	8	23926	23933	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_002929	CAC	2	6	23947	23952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_002929	GCA	2	6	23955	23960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_002929	GCG	2	6	23974	23979	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_002929	GAT	2	6	24037	24042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_002929	CAG	2	6	24079	24084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_002929	GTC	3	9	24136	24144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_002929	GCTG	2	8	24169	24176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
124	NC_002929	GCCG	2	8	24177	24184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_002929	GCC	2	6	24232	24237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_002929	CAG	2	6	24247	24252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_002929	ATG	2	6	24284	24289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_002929	GC	3	6	24295	24300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_002929	GCCA	2	8	24302	24309	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
130	NC_002929	CGGG	2	8	24314	24321	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_002929	GCG	4	12	24337	24348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_002929	TC	3	6	25465	25470	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_002929	GTC	2	6	25480	25485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_002929	CGT	2	6	25491	25496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_002929	CTGCGG	2	12	25501	25512	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_002929	GCAACT	2	12	25581	25592	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_002929	CG	3	6	25677	25682	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_002929	A	6	6	25705	25710	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_002929	GGC	2	6	25736	25741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_002929	GCG	2	6	25845	25850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_002929	GCC	2	6	25858	25863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
142	NC_002929	CG	3	6	25865	25870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
143	NC_002929	CGG	2	6	25880	25885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_002929	GTC	2	6	25908	25913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_002929	GCCT	2	8	25917	25924	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_002929	TCG	2	6	26020	26025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_002929	GCC	2	6	26086	26091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_002929	CTG	2	6	26148	26153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_002929	TGC	2	6	26158	26163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_002929	GCG	2	6	26271	26276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
151	NC_002929	CG	3	6	26280	26285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_002929	TCG	2	6	26295	26300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_002929	CCGG	2	8	28234	28241	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_002929	G	7	7	28258	28264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
155	NC_002929	CCG	2	6	28383	28388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_002929	CTT	2	6	28426	28431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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160	NC_002929	CGTGT	2	10	28517	28526	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
161	NC_002929	CAA	3	9	28573	28581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_002929	CTT	2	6	28668	28673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
163	NC_002929	CCT	2	6	30872	30877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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165	NC_002929	TCG	2	6	30936	30941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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169	NC_002929	TTG	2	6	31989	31994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_002929	GC	3	6	32128	32133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
172	NC_002929	GCG	2	6	32166	32171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
173	NC_002929	C	6	6	33029	33034	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
174	NC_002929	GA	3	6	33039	33044	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
175	NC_002929	GCCGG	2	10	34472	34481	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
176	NC_002929	CCGG	2	8	34618	34625	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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179	NC_002929	CCG	2	6	36923	36928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_002929	GC	3	6	36977	36982	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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183	NC_002929	ATC	2	6	43383	43388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_002929	CCG	2	6	43409	43414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_002929	CGG	2	6	43418	43423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_002929	GCC	2	6	43435	43440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
188	NC_002929	GC	3	6	43454	43459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
189	NC_002929	CGC	3	9	43457	43465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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194	NC_002929	GGC	2	6	43556	43561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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433	NC_002929	GGC	2	6	82429	82434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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436	NC_002929	CAG	2	6	82594	82599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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471	NC_002929	GCC	2	6	98762	98767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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476	NC_002929	CGG	2	6	98954	98959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
477	NC_002929	CAG	2	6	98973	98978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
478	NC_002929	CGG	2	6	98987	98992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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481	NC_002929	CGGGC	2	10	99072	99081	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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